Com o intuito de estimular a diversificação de atividades e/ou culturas nas propriedades rurais e oferecer produtos de qualidade com preços justos, a Afubra criou, no fim da década de 1950, o Departamento de Fomento Agropecuário. Com a evolução, o segmento deu origem, em 1994, à Agro-Comercial Afubra Ltda. A rede atual é composta por 29 lojas, sendo dezesseis lojas e um posto de vendas no Rio Grande do Sul; nove lojas em Santa Catarina e quatro lojas no Paraná; além do e-commerce, plataforma de compras on-line; dois centros de distribuição, localizados em Santa Cruz do Sul/RS e Mafra/SC; e a Unidade de Grãos, em Rio Pardo/RS., que oportuniza diversificação de culturas e de mercado aos associados e clientes.
A Agro-Comercial Afubra Ltda. se destaca pela grande parceria com a comunidade e pela busca contínua para introdução de novas tecnologias que aumentam a produtividade e a lucratividade do produtor rural. Além deste olhar atento às necessidades do campo, mantém uma ampla e completa linha de produtos, como sementes, fertilizantes, defensivos, máquinas, ferramentas, ferragens, eletrodomésticos, som e imagem, informática, bazar, móveis, camping e lazer, tintas e acessórios, energia solar, entre outros.
Em Tubarão:
A filial de Tubarão foi a terceira a ser inaugurada, em 30 de abril de 1975. São 48 anos de uma história, onde a Afubra preza pelo bem-estar de seus associados e clientes. Atualmente, são 34 funcionários, sob a gerência de Jayson Mendes, que atendem toda a organização mutualista, comercial e institucional.
Além do Sistema Mutualista e das lojas da Agro-Comercial Afubra Ltda., a Afubra mantém o Verde é Vida (programa de educação socioambiental e rural – há 31 anos), o Viveiro Agroflorestal (que produz mudas de árvores nativas e exóticas e de culturas agrícolas – há 32 anos), a Expoagro Afubra (maior feira do Brasil voltada à agricultura familiar – em 2023 a 21ª edição), o Recolhimento de Óleo Saturado (há 14 anos) e outras ações sociais, ambientais e de incentivo à diversificação.